RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BQV1 296 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 IFFO2Q5TF58 517 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 C8orf76Q96K31 380 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF3AQ9Y496 699 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 MCM4P33991 863 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K11Q16584 847 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ACER1Q8TDN7 264 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 KLRG1Q96E93 195 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KLRF2D3W0D1 207 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 APLP1P51693 650 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.45■■□□□ 1.66
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PACSIN3-209ENST00000532457 ECE1P42892 770 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 DEXIO95424 95 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 RESTQ13127 1097 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 WRNIP1Q96S55 665 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 INPP5BP32019 993 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT40Q6A162 431 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 GNAQP50148 359 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K9P80192 1104 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 NBR1Q14596 966 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.666e-7■■□□□ 13.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 CSADQ9Y600 493 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 F5H6K3 240 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KLRC3Q07444 240 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF543Q08ER8 600 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QTNF8P60827 252 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 SLFN13Q68D06 897 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 GBP4Q96PP9 640 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 CREBZFQ9NS37 354 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 MYH6P13533 1939 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 HUNKP57058 714 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 MCTP1Q6DN14 999 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 MOB2Q70IA6 237 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD1Q719H9 257 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 WASF1Q92558 559 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF28PB7ZC32 967 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 TMX2Q9Y320 296 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 TCHHQ07283 1943 aa25.39■■□□□ 1.66
PACSIN3-209ENST00000532457 RAD21O60216 631 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFB10O96000 172 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 ASNSP08243 561 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 GINM1Q9NU53 330 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 RGS22Q8NE09 1264 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCA1P28370 1054 aa25.37■■□□□ 1.65
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PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SCG2P13521 617 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF4Q8WV16 495 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 PICK1Q9NRD5 415 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC1A4P43007 532 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 VGLL4Q14135 290 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC96Q2M329 555 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTS3O15072 1205 aa25.35■■□□□ 1.65
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