RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 SRRDQ9UH36 339 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 Q3C1V9 767 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ATG4CQ96DT6 458 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC14Q96N46 770 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 BTBD7Q9P203 1132 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 IQCA1Q86XH1 822 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 MB21D1Q8N884 522 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 GMCL1Q96IK5 515 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-208ENST00000531226 CCNA1P78396 465 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TRDNQ13061 729 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 COA7Q96BR5 231 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH6P13533 1939 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 E7EWF7 191 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP3P12645 472 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPK4P31152 587 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKCZQ05513 592 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 DGKHQ86XP1 1220 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PORCNQ9H237 461 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC1A4P43007 532 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 NECTIN1Q15223 517 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 NCOA7Q8NI08 942 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 FEM1BQ9UK73 627 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 GABRQQ9UN88 632 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TNKSO95271 1327 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 VWA5AO00534 786 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC27A2O14975 620 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MCCP23508 829 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF4Q8WV16 495 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 FLT3LGP49771 235 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RAET1EQ8TD07 263 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKS1AQ92625 1134 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR7Q9Y216 660 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 HTTP42858 3142 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM232C9JQI7 657 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G6O60733 806 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CAPN15O75808 1086 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 STAT2P52630 851 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 IRF5Q13568 498 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD1Q719H9 257 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR142Q7Z601 462 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM160B2Q86V87 743 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 REPS2Q8NFH8 660 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.34■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PDHBP11177 359 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PLS1Q14651 629 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC96Q2M329 555 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 KIFC2Q96AC6 838 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ARMC5Q96C12 935 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 GJD2Q9UKL4 321 aa22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SNHG28P0DPA3 235 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC23AQ15436 765 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF20Q5VTR2 975 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA1Q8ND90 353 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 KAT14Q9H8E8 782 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ERCC3P19447 782 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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