RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 PADI6Q6TGC4 694 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GMLQ99445 158 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KAT14Q9H8E8 782 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SENP2Q9HC62 589 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.71□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 NBPF11Q86T75 865 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 ALG1Q9BT22 464 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MXD3Q9BW11 206 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.7□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SMIM22K7EJ46 135 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PSMD14O00487 310 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.022e-12■■□□□ 12.2
SEC31A-241ENST00000515749 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PICALMQ13492 652 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GRM4Q14833 912 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DLGAP5Q15398 846 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 CFAP100Q494V2 611 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KRT40Q6A162 431 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FERMT3Q86UX7 667 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PNMA1Q8ND90 353 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SPATA32Q96LK8 384 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MYL10Q9BUA6 226 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SPON1Q9HCB6 807 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MYH4Q9Y623 1939 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MYO1BO43795 1136 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RXRAP19793 462 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 CXCL9Q07325 125 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FUT2Q10981 343 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FAM83AQ86UY5 434 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GPT2Q8TD30 523 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PHKBQ93100 1093 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FIBPO43427 364 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 NMT2O60551 498 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 RAD17O75943 681 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 YEATS4O95619 227 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TTLL1O95922 423 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MMP1P03956 469 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 GALNT17Q6IS24 598 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 FAM151AQ8WW52 585 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 DPF2Q92785 391 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MKL1Q969V6 931 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 STX8Q9UNK0 236 aa8.67□□□□□ -1.02
SEC31A-241ENST00000515749 BCS1LQ9Y276 419 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms