RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGA4P13612 1032 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX5P35711 763 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF180Q86T96 592 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 CDH24Q86UP0 819 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SVOPQ8N4V2 548 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 RIN3Q8TB24 985 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 IER2Q9BTL4 223 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.71□□□□□ -0.69
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PGGT1B-205ENST00000514178 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 FBXL18Q96ME1 805 aa10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 LGR6Q9HBX8 967 aa10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 PIK3R2O00459 728 aa10.69□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZS46 218 aa10.69□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 CEP41Q9BYV8 373 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGEF15O94989 841 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNH1O95259 989 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 NFICP08651 508 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GLB1P16278 677 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 MAP7Q14244 749 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 SGO2Q562F6 1265 aa10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-205ENST00000514178 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 FIBCD1Q8N539 461 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 MCM8Q9UJA3 840 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 USP21Q9UK80 565 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 BLACEA4D250 179 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM83GA6ND36 823 aa10.65□□□□□ -0.7
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