RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 B4E1Z4 1266 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PDE8AO60658 829 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PEX14O75381 377 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RFPL1O75677 317 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 EYA4O95677 639 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DRD2P14416 443 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 C4orf46Q504U0 113 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TRAPPC3LQ5T215 181 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 DCAF11Q8TEB1 546 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 RPS6KC1Q96S38 1066 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC22A31A6NKX4 558 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 CYP11A1P05108 521 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NAT1P18440 290 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CDC27P30260 824 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FLT3P36888 993 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ARL4DP49703 201 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GSTM4Q03013 218 aa2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE3A6NKU9 549 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CREB3O43889 395 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 APPP05067 770 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FBLN7Q53RD9 439 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 CYFIP1Q7L576 1253 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 C11orf96Q7Z7L8 435 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 JAMLQ86YT9 394 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PASD1Q8IV76 773 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 ATL2Q8NHH9 583 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 MENTQ9BUN1 341 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PRR13Q9NZ81 148 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GABBR1Q9UBS5 961 aa2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 PURAQ00577 322 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 CDC6Q99741 560 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-218ENST00000509368 MORC3Q14149 939 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1211LQ6NV74 962 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MAP4K3Q8IVH8 894 aa2.92□□□□□ -1.94
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