RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 MYLIPQ8WY64 445 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 ATG4CQ96DT6 458 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 SYNJ1O43426 1573 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 GBP1P32455 592 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 MLECQ14165 292 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 NR0B2Q15466 257 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 SEZ6Q53EL9 994 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 HDAC8Q9BY41 377 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 ABCC8Q09428 1581 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 CLASP1Q7Z460 1538 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 CCNFP41002 786 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN15O95858 294 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 RAG1P15918 1043 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 NOTOA8MTQ0 251 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF4P78317 190 aa7.98□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 LCE1DQ5T752 114 aa7.98□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.98□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 SHISA4Q96DD7 197 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 TOX2Q96NM4 488 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 RNF32Q9H0A6 362 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF165P49910 485 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-217ENST00000509355 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.97□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM192Q8IY95 271 aa7.97□□□□□ -1.13
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PDE4D-217ENST00000509355 FBLN7Q53RD9 439 aa7.96□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 KCNK12Q9HB15 430 aa7.96□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 EFEMP2O95967 443 aa7.95□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF76P36508 570 aa7.95□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.95□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 MED14OSP0DP75 135 aa7.94□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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PDE4D-217ENST00000509355 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.94□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.94□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.94□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.93□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 ACRP10323 421 aa7.93□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 VAMP1P23763 118 aa7.93□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 MCM4P33991 863 aa7.93□□□□□ -1.14
PDE4D-217ENST00000509355 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
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