RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506438.5

PITX1-205, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-205ENST00000506438 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 COL6A1P12109 1028 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 GPR153Q6NV75 609 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 DEFB123Q8N688 67 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 MB21D1Q8N884 522 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-205ENST00000506438 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 RILPL2Q969X0 211 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 DLL1O00548 723 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 RASA1P20936 1047 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 PTPREP23469 700 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 CNGA1P29973 690 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 HIP1O00291 1037 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 PPARAQ07869 468 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 BTBD7Q9P203 1132 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 NYAP2Q9P242 653 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SMIM22K7EJ46 135 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 FLOT1O75955 427 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 Q7L0L9 218 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 TSPY3P0CV98 308 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 TSPY8P0CW00 308 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 GRB14Q14449 540 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 RAD21O60216 631 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 MSCO60682 206 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 DSG3P32926 999 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 ALX1Q15699 326 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX1-205ENST00000506438 LAMA3Q16787 3333 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 TTLL1O95922 423 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 HOXC6P09630 235 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CYP2C19P33261 490 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 DPP9Q86TI2 863 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.19■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 STRNO43815 780 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PRDM1O75626 825 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SDSP20132 328 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 FAM227BQ96M60 508 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MKL1Q969V6 931 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MROH8Q9H579 483 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 ZMYM6O95789 1325 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 A0A0D9SFI3 127 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 F5H6K3 240 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 DNM1LO00429 736 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 TFAP4Q01664 338 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 KLRC3Q07444 240 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CEP95Q96GE4 821 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MYH8P13535 1937 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 TSPY2A6NKD2 308 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SLC25A27O95847 323 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 ADORA2AP29274 412 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 COPB2P35606 906 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PLS1Q14651 629 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 FGAP02671 866 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 VPS53Q5VIR6 699 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 TRPV1Q8NER1 839 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.14■■□□□ 1.62
PITX1-205ENST00000506438 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms