RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504078.1

USP46-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, human

TSL 4

Gene USP46, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP46-205	ENST00000504078	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PFAS	O15067	1338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	MX2	P20592	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ITGB7	P26010	798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	MAP2K3	P46734	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	FOXO4	P98177	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	FLII	Q13045	1269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	VCAN	P13611	3396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	GNRH1	P01148	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	CSF1R	P07333	972 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PRDX5	P30044	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	GNAI1	P63096	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PPAT	Q06203	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PICALM	Q13492	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	DBN1	Q16643	649 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	TRIB2	Q92519	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP46-205	ENST00000504078		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.59	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	HMGCR	P04035	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	CYP2B6	P20813	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	MMP14	P50281	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	FOSL2	P15408	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	PTPRA	P18433	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	BMP8B	P34820	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	RGS3	P49796	1198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	HMGCS2	P54868	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP46-205	ENST00000504078	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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