RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 PARP14Q460N5 1801 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.54■■■□□ 2.32
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CXCL3-202ENST00000502974 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 BTBD7Q9P203 1132 aa29.54■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PLXNB2O15031 1838 aa29.54■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 F5H6K3 240 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 SGSM2O43147 1006 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 NMT2O60551 498 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 INHAP05111 366 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
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CXCL3-202ENST00000502974 KLRC3Q07444 240 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 WDR78Q5VTH9 848 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 GPR142Q7Z601 462 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 MKL1Q969V6 931 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.53■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 NDUFB10O96000 172 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.52■■■□□ 2.32
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CXCL3-202ENST00000502974 MB21D1Q8N884 522 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 RNF208Q9H0X6 261 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 STX8Q9UNK0 236 aa29.52■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 NEDD4P46934 1319 aa29.51■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 DSG3P32926 999 aa29.51■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 PTH1RQ03431 593 aa29.51■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.51■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 CYP2B6P20813 491 aa29.5■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 ATG4CQ96DT6 458 aa29.5■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.5■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 HMGCRP04035 888 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.49■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 RGS2P41220 211 aa29.48■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 PLS1Q14651 629 aa29.48■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.48■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 ESR2Q92731 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 GJB1P08034 283 aa29.47■■■□□ 2.31
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CXCL3-202ENST00000502974 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.47■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 MORN1Q5T089 497 aa29.46■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.46■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.46■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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CXCL3-202ENST00000502974 APBA2Q99767 749 aa29.45■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.45■■■□□ 2.31
CXCL3-202ENST00000502974 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 B4E1Z4 1266 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 PTPREP23469 700 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 GJA8P48165 433 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 NOVP48745 357 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MAP2K5Q13163 448 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 USP6NLQ92738 828 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.44■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
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CXCL3-202ENST00000502974 BMP3P12645 472 aa29.43■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.43■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.43■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR7Q9Y216 660 aa29.43■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 ERCC3P19447 782 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MCCP23508 829 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 NT5C2P49902 561 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MAP4K1Q92918 833 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 SHISA4Q96DD7 197 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 GMCL1Q96IK5 515 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 KRT23Q9C075 422 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.42■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.42■■■□□ 2.3
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CXCL3-202ENST00000502974 CDC45O75419 566 aa29.41■■■□□ 2.3
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CXCL3-202ENST00000502974 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 SLC1A4P43007 532 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM32Q13049 653 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 GRB14Q14449 540 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-202ENST00000502974 MROH8Q9H579 483 aa29.41■■■□□ 2.3
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