RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	APBB1	O00213	710 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CIAO1	O76071	339 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ANP32C	O43423	234 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	AVP	P01185	164 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPD1	P17405	629 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	COL6A3	P12111	3177 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ADORA1	P30542	326 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIB2	Q92519	343 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QL48	77 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHC	P07864	332 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTO1	P78417	241 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CAP2	P40123	477 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MECOM	Q03112	1051 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM10	P62072	90 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PTK2	Q05397	1052 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	PFAS	O15067	1338 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUL7	405 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK4	P31152	587 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS2	P41220	211 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDL3	P58872	404 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX10	O60683	326 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ASNS	P08243	561 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	BACE1	P56817	501 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HERVK_113	P62684	666 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28

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