RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 Q3C1V9 767 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SLFN13Q68D06 897 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 KRT23Q9C075 422 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TRIM17Q9Y577 477 aa10.2□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MYH4Q9Y623 1939 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PCNTO95613 3336 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 FLOT1O75955 427 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PYGBP11216 843 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PSMC4P43686 418 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 COG2Q14746 738 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ATG4CQ96DT6 458 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 BTBD7Q9P203 1132 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MTMR7Q9Y216 660 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RLFQ13129 1914 aa10.19□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TNKSO95271 1327 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 BMP3P12645 472 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MCCP23508 829 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 NT5C2P49902 561 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ANTXR2P58335 489 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ERVK-9P63128 1117 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ERVK-24P63145 666 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TRDNQ13061 729 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 KIF22Q14807 665 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 LBX2Q6XYB7 198 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CHST3Q7LGC8 479 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 IQCA1Q86XH1 822 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 DGKHQ86XP1 1220 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 NCOA7Q8NI08 942 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TRIM47Q96LD4 638 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TTC14Q96N46 770 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 EFCC1Q9HA90 598 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.18□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PARP14Q460N5 1801 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 MYPNQ86TC9 1320 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SLC1A4P43007 532 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 FCGRTP55899 365 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SEC23AQ15436 765 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 KCTD1Q719H9 257 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TNS4Q8IZW8 715 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ANKS1AQ92625 1134 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GMCL1Q96IK5 515 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PORCNQ9H237 461 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SENP2Q9HC62 589 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.17□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TMEM232C9JQI7 657 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 REC8O95072 547 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PDHBP11177 359 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 HSPA4P34932 840 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CCDC96Q2M329 555 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 RNF20Q5VTR2 975 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 REPS2Q8NFH8 660 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 DCAF4Q8WV16 495 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 KCNB2Q92953 911 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 KIFC2Q96AC6 838 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 GABRQQ9UN88 632 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.16□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 VWA5AO00534 786 aa10.15□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SNHG28P0DPA3 235 aa10.15□□□□□ -0.78
PKP4-216ENST00000495123 SLC16A2P36021 539 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms