RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491804.1

MFSD1-218, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene MFSD1, Length 312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-218ENST00000491804 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.03■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.03■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 GOPCQ9HD26 462 aa23.03■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.03■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 SEPT4O43236 478 aa23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 GPR153Q6NV75 609 aa23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 OSBP2Q969R2 916 aa23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 GPATCH3Q96I76 525 aa23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 MAML3Q96JK9 1138 aa23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MFSD1-218ENST00000491804 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 APPBP2Q92624 585 aa23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 VWA5AO00534 786 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 RAD21O60216 631 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 RASA1P20936 1047 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 STAT3P40763 770 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ANO1Q5XXA6 986 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 MKNK2Q9HBH9 465 aa23■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 MMP19Q99542 508 aa22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 NYAP2Q9P242 653 aa22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.98■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 KCTD2Q14681 263 aa22.98■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 REPS2Q8NFH8 660 aa22.98■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.98■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 KBTBD13C9JR72 458 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 GPAA1O43292 621 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 PGK2P07205 417 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 GNAT2P19087 354 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 F5H6K3 240 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 COPB2P35606 906 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 RTP1P59025 263 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 KLRC3Q07444 240 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 DEFB123Q8N688 67 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.96■■□□□ 1.27
MFSD1-218ENST00000491804 APPP05067 770 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TDO2P48775 406 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TINF2Q9BSI4 451 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.95■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 M0R2C6 588 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 NDUFB10O96000 172 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 LRRC41Q15345 812 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.94■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 MKL1Q969V6 931 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.93■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ERC2O15083 957 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PRDM1O75626 825 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SNX17Q15036 470 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 Q7L0L9 218 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 FERMT2Q96AC1 680 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.92■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 RARBP10826 455 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 CEP95Q96GE4 821 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 RIPK3Q9Y572 518 aa22.91■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ATP2A1O14983 1001 aa22.9■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 TRIM60Q495X7 471 aa22.9■■□□□ 1.26
MFSD1-218ENST00000491804 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms