RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SHISA3A0PJX4 238 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BS24 57 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 EPHX1P07099 455 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NCAPHQ15003 741 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf61Q8IZ16 206 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NETO1Q8TDF5 533 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 FGD4Q96M96 766 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPA12BQ96MM6 686 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL25Q9H0H3 589 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 GFOD1Q9NXC2 390 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MINPP1Q9UNW1 487 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ST14Q9Y5Y6 855 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 WASH4PA8MWX3 477 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SUSD5O60279 629 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MED26O95402 600 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CD247P20963 164 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 RASA3Q14644 834 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MSMPQ1L6U9 139 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PIF1Q9H611 641 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 GP6Q9HCN6 339 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SNTG2Q9NY99 539 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF112Q9ULX5 631 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MEIS1O00470 390 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 COBLO75128 1261 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF1O95521 474 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SRFP11831 508 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SSTR4P31391 388 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIK1P39086 918 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCN7P51798 805 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 TCEAL1Q15170 157 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCY4Q8NFM4 1077 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 BRF1Q92994 677 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 LGR4Q9BXB1 951 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PDPK1O15530 556 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGLEC6O43699 453 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGA4P13612 1032 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CD96P40200 585 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF445P59923 1031 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 BNIP3Q12983 259 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 AOC3Q16853 763 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2FQ969M7 185 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MKL1Q969V6 931 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 APBA2Q99767 749 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 HDAC8Q9BY41 377 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 GBP3Q9H0R5 595 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST7Q9NS84 486 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 WHRNQ9P202 907 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 MYO15BQ96JP2 1530 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-211ENST00000489450 PPM1BO75688 479 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CD97P48960 835 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 RASGRF1Q13972 1273 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2R5DQ14738 602 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 NFE2L2Q16236 605 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SV2CQ496J9 727 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATC1Q76KD6 591 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 FIBCD1Q8N539 461 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms