RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GUL7	405 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF5L	O75529	589 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KA4	O75676	772 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MICAL2	O94851	1124 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFR2	P21802	821 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	INPP5B	P32019	993 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM182B	Q5T319	152 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SUSD4	Q5VX71	490 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	IER5	Q5VY09	327 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0D9SFI3	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	OPLAH	O14841	1288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB39	O15060	712 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PTMS	P20962	102 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	GPT	P24298	496 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MCM4	P33991	863 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPA1L	P34931	641 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP2K3	P46734	347 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	NEK4	P51957	841 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNQ4	P56696	695 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	NUCB2	P80303	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PTH1R	Q03431	593 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMC2	Q13753	1193 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	HIF1A	Q16665	826 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS53	Q5VIR6	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TMX3	Q96JJ7	454 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM227B	Q96M60	508 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FSD1	Q9BTV5	496 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	GREM2	Q9H772	168 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	GGA1	Q9UJY5	639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN7A	Q01118	1682 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	AFF2	P51816	1311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE8B	O95263	885 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ECM1	Q16610	540 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNE4	Q8N205	404 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	NARF	Q9UHQ1	456 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMB2	P55268	1798 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC27A2	O14975	620 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	BCR	P11274	1271 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	MPST	P25325	297 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMA5	P28066	241 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM10	P62072	90 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT32	Q14532	448 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP2B3	Q16720	1220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL24	Q5JXM2	366 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL16	Q8N461	479 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	LPIN2	Q92539	896 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	GBP4	Q96PP9	640 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL11A	Q9H165	835 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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