RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488023.1

HFM1-208, Transcript of HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog, human

TSL 5

Gene HFM1, Length 1,699 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HFM1-208	ENST00000488023	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	RAB33A	Q14088	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	HDX	Q7Z353	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	GREM1	O60565	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	RLBP1	P12271	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	LMNB1	P20700	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	CDC45	O75419	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	SYN1	P17600	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	LMNB2	Q03252	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	FAM221A	A4D161	298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	LRIG2	O94898	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PF4	P02776	101 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	CAP2	P40123	477 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	NFKB2	Q00653	900 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	INPP5A	Q14642	412 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HFM1-208	ENST00000488023	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	NUAK1	O60285	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GYS2	P54840	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023		H3BS24	57 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLITRK5	O94991	958 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SOX9	P48436	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	PWP1	Q13610	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	HID1	Q8IV36	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HFM1-208	ENST00000488023	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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