RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPY26PQ9H489 355 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH8P13535 1937 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRF2D3W0D1 207 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SMARCA1P28370 1054 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TNIP1Q15025 636 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC39A14Q15043 492 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ADALQ6DHV7 355 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SHISA4Q96DD7 197 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC18Q9H819 358 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 DACT1Q9NYF0 836 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR7Q9Y216 660 aa11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CALML3P27482 149 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP14P50281 582 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NR5A1Q13285 461 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPAQ15257 358 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FSIP1Q8NA03 581 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 OXER1Q8TDS5 423 aa11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CLRN2A0PK11 232 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L5A8MUK1 530 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CYTH3O43739 400 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP6R2O75170 966 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NR1I2O75469 434 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 EGFRP00533 1210 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SNHG28P0DPA3 235 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PDHBP11177 359 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP5P59047 1200 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K11Q16584 847 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MICALL2Q8IY33 904 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC148Q8NFR7 591 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM151AQ8WW52 585 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TNMDQ9H2S6 317 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.92□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM196BA6NMK8 535 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAF5O00463 557 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO1BO43795 1136 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 KINO60870 393 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NPY5RQ15761 445 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GALNT17Q6IS24 598 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 DPF2Q92785 391 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFRSF25Q93038 417 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CSRNP1Q96S65 589 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RBSNQ9H1K0 784 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CABP5Q9NP86 173 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 NYAP2Q9P242 653 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.91□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM75PA6NK02 468 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RASSF10A6NK89 507 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms