RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 FERMT3Q86UX7 667 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP6-208ENST00000483859 VWCEQ96DN2 955 aa5.5□□□□□ -1.53
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SENP6-208ENST00000483859 F6X3S4 739 aa5.49□□□□□ -1.53
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SENP6-208ENST00000483859 NCKAP1LP55160 1127 aa5.49□□□□□ -1.53
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SENP6-208ENST00000483859 NLRX1Q86UT6 975 aa5.48□□□□□ -1.53
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SENP6-208ENST00000483859 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.48□□□□□ -1.53
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SENP6-208ENST00000483859 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 ZNF827Q17R98 1081 aa5.44□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 UBXN11Q5T124 520 aa5.44□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 ZNF76P36508 570 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 ETV3P41162 512 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 HMGA2P52926 109 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 MAP3K11Q16584 847 aa5.43□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.42□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 PGRP06401 933 aa5.42□□□□□ -1.54
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SENP6-208ENST00000483859 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 SEPT6Q14141 434 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 ZPBP2Q6X784 338 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 GFRA2O00451 464 aa5.41□□□□□ -1.54
SENP6-208ENST00000483859 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
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