RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 TRIM75PA6NK02 468 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 FOXN1O15353 648 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PPP6R2O75170 966 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PTPREP23469 700 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CDC25AP30304 524 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 MCM7P33993 719 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 KRT2P35908 639 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PTGDRQ13258 359 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PNOCQ13519 176 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 UVSSAQ2YD98 709 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SPC24Q8NBT2 197 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 RGS22Q8NE09 1264 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 EPSTI1Q96J88 318 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 DNAJC18Q9H819 358 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CTAGE5O15320 804 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SHMT1P34896 483 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SLC16A2P36021 539 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 GRM4Q14833 912 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 RESP18Q5W5W9 173 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 KLHL34Q8N239 644 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TNFRSF25Q93038 417 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PHF12Q96QT6 1004 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CSRNP2Q9H175 543 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 LTBP1Q14766 1721 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 MYH6P13533 1939 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CLRN2A0PK11 232 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CUTAO60888 179 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PDHBP11177 359 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 IQCB1Q15051 598 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 BLIDQ8IZY5 108 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CNNM3Q8NE01 707 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PIGSQ96S52 555 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TRIM5Q9C035 493 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 HPSEQ9Y251 543 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SNED1Q8TER0 1413 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 A0A087X0B3 334 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 BECN2A8MW95 431 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 PSMD14O00487 310 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TTLL1O95922 423 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 HLA-DOAP06340 250 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 GNAQP50148 359 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 JAG1P78504 1218 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 STX1AQ16623 288 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 INF2Q27J81 1249 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CFAP100Q494V2 611 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 TTC38Q5R3I4 469 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 KCTD1Q719H9 257 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 OGFOD1Q8N543 542 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 STAMQ92783 540 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 BARHL2Q9NY43 387 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.72□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 MYH1P12882 1939 aa4.71□□□□□ -1.65
USP25-208ENST00000478932 SMCO2A6NFE2 343 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GDF11O95390 407 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 BMP6P22004 513 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CALML3P27482 149 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CASP1P29466 404 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NAPAP54920 295 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SEPT2Q15019 361 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 IL17AQ16552 155 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC93Q567U6 631 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.71□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms