RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	RLF	Q13129	1914 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	BMP3	P12645	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	CTGF	P29279	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	HSPA4	P34932	840 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ANTXR2	P58335	489 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ERVK-24	P63145	666 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	KIF22	Q14807	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	SEC23A	Q15436	765 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SFI1-222	ENST00000478887	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PLA2G6	O60733	806 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	GNRH1	P01148	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PDHB	P11177	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SLC1A4	P43007	532 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FCGRT	P55899	365 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	VWA5A	O00534	786 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PEX10	O60683	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	MCC	P23508	829 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PSMC4	P43686	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	STAT2	P52630	851 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	KRT32	Q14532	448 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887		Q3C1V9	767 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ERICH2	A1L162	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PRC1	O43663	620 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FDX1	P10109	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	MAPK4	P31152	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	MCM5	P33992	734 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PRMT2	P55345	433 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	CCNA1	P78396	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	WTAP	Q15007	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PORCN	Q9H237	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SFI1-222	ENST00000478887	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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