RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TBX21	Q9UL17	535 aa		12.87	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.87	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PGK2	P07205	417 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	AKR1A1	P14550	325 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ACLY	P53396	1101 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TMEM240	Q5SV17	173 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	CCDC174	Q6PII3	467 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	FAM122A	Q96E09	287 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	MMP19	Q99542	508 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PBX4	Q9BYU1	374 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.86	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PBX2	P40425	430 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	KCTD2	Q14681	263 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	VCPKMT	Q9H867	229 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TMX2	Q9Y320	296 aa		12.85	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	TRIM27	P14373	513 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	EVX2	Q03828	476 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SH2D4A	Q9H788	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	SWAP70	Q9UH65	585 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	REV3L	O60673	3130 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	ELP1	O95163	1332 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	PARP14	Q460N5	1801 aa		12.83	□□□□□ -0.35
APTX-222	ENST00000478279	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	STAT3	P40763	770 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CDK7	P50613	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	KCNA10	Q16322	511 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	TMEM199	Q8N511	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	TNN	Q9UQP3	1299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	TRANK1	O15050	2925 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	BCAR3	O75815	825 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CSF2RA	P15509	400 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	IGFBP4	P22692	258 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	COPB2	P35606	906 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	ICA1	Q05084	483 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	RAB30	Q15771	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	ZNF365	Q70YC5	407 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	PIEZO1	Q92508	2521 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	ACR	P10323	421 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CYP2D6	P10635	497 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	AKR1B1	P15121	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APTX-222	ENST00000478279	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36

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