RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PDHXO00330 501 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 BMP3P12645 472 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 SLC1A4P43007 532 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 APOBRQ0VD83 1088 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 MYL10Q9BUA6 226 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 MTMR7Q9Y216 660 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-210ENST00000477812 NID2Q14112 1375 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CCDC69A6NI79 296 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L15C9J2P7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L11C9JVI0 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L18D6R9N7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L22D6RA61 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L19D6RCP7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L20D6RJB6 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 RAD21O60216 631 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 AK2P54819 239 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FGD1P98174 961 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 USP17L24Q0WX57 530 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 GRM4Q14833 912 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K14Q99558 947 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 RCAN1P53805 252 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 KCTD1Q719H9 257 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G6O60733 806 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CYP2C8P10632 490 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CCDC96Q2M329 555 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 MICU3Q86XE3 530 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 MYPNQ86TC9 1320 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB43O43298 467 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CALM1P0DP23 149 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CALM2P0DP24 149 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CALM3P0DP25 149 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 RXRAP19793 462 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD1Q15327 319 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 LBX2Q6XYB7 198 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 JMYQ8N9B5 988 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 IL27Q8NEV9 243 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FEM1BQ9UK73 627 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PNMA3Q9UL41 463 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 TMEM232C9JQI7 657 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FLOT1O75955 427 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ALDH1A1P00352 501 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 OSBPP22059 807 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 STAT2P52630 851 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 COG2Q14746 738 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 FANCBQ8NB91 859 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 RNF186Q9NXI6 227 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-210ENST00000477812 CA12O43570 354 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 DSG3P32926 999 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 HERVK_113P62684 666 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 CRHR2Q13324 411 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 FAM160B2Q86V87 743 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 SLC16A2P36021 539 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-210ENST00000477812 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.25■■□□□ 1.31
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