RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 ELNP15502 786 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 MB21D1Q8N884 522 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 MKL1Q969V6 931 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 MTMR7Q9Y216 660 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 FGRP09769 529 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 UBXN2AP68543 259 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SLFN13Q68D06 897 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 GPR142Q7Z601 462 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 NBPF3Q9H094 633 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 CYP2B6P20813 491 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 IRF5Q13568 498 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 ESR2Q92731 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 NEDD4P46934 1319 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-202ENST00000468358 HTTP42858 3142 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SGSM2O43147 1006 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 PLXNB2O15031 1838 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 BMP3P12645 472 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SLC1A4P43007 532 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KIFC2Q96AC6 838 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 GJD2Q9UKL4 321 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KDM4AO75164 1064 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MCCP23508 829 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 PTH1RQ03431 593 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MTFR1Q15390 333 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 FEM1BQ9UK73 627 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 POTEFA5A3E0 1075 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 B4E1Z4 1266 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM232C9JQI7 657 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 VWA5AO00534 786 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 INHAP05111 366 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 ERCC3P19447 782 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 RGS2P41220 211 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SLC4A3P48751 1232 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC96Q2M329 555 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 IQCA1Q86XH1 822 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 ZBED4O75132 1171 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 CCL5P13501 91 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 PTPREP23469 700 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KCTD1Q719H9 257 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 GMCL1Q96IK5 515 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 KRT23Q9C075 422 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 RNF208Q9H0X6 261 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 HMGCRP04035 888 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 STAT3P40763 770 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 RGS19P49795 217 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 STAT2P52630 851 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 TRDNQ13061 729 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MAP2K5Q13163 448 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MORN1Q5T089 497 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 CASC1Q6TDU7 716 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 CPXCR1Q8N123 301 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 APBA2Q99767 749 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 MROH8Q9H579 483 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.4■□□□□ 0.86
CLDN11-202ENST00000468358 SLC25A27O95847 323 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 NT5C2P49902 561 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 DPP9Q86TI2 863 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CENPFP49454 3210 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms