RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SCRIB	Q14160	1630 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	GBP1	P32455	592 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	CHRNE	Q04844	493 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SNX17	Q15036	470 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	EFEMP2	O95967	443 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	RAG1	P15918	1043 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	CLC	Q05315	142 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	NFIB	O00712	420 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	DUSP4	Q13115	394 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	PEX10	O60683	326 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	BBS9	Q3SYG4	887 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCB4-208	ENST00000467983	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	PSPN	O60542	156 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF165	P49910	485 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNA10	Q16322	511 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	NRDC	O43847	1150 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	PRAMEF1	O95521	474 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	HRK	O00198	91 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	SEMA7A	O75326	666 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	CLEC3A	O75596	197 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	NKD1	Q969G9	470 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC9A7	Q96T83	725 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	FANCC	Q00597	558 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNN1	Q92952	543 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	GPR160	Q9UJ42	338 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCB4-208	ENST00000467983	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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