RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SOGA3-204ENST00000464495 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
SOGA3-204ENST00000464495 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.95□□□□□ -0.5
SOGA3-204ENST00000464495 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.95□□□□□ -0.5
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SOGA3-204ENST00000464495 SIPA1L1O43166 1804 aa11.95□□□□□ -0.5
SOGA3-204ENST00000464495 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
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