RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463553.1

TDRKH-208, Transcript of tudor and KH domain containing, humanhuman

TSL 3

Gene TDRKH, Length 371 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKH-208ENST00000463553 TMX2Q9Y320 296 aa20.24■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 MBD4O95243 580 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 EPHB4P54760 987 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 TLE2Q04725 743 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 MB21D1Q8N884 522 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 MYLIPQ8WY64 445 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 VCPKMTQ9H867 229 aa20.23■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 PGK1P00558 417 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 FCER1AP12319 257 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 SWAP70Q9UH65 585 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.22■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.21■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 MMP19Q99542 508 aa20.21■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.21■□□□□ 0.83
TDRKH-208ENST00000463553 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ADD2P35612 726 aa20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 CDK8P49336 464 aa20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 PHF24Q9UPV7 400 aa20.2■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 USP17L12C9JPN9 530 aa20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 USP17L21D6R901 530 aa20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 RAD21O60216 631 aa20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 C12orf60Q5U649 245 aa20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.19■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 RARBP10826 455 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 TINF2Q9BSI4 451 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.18■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 TTC28Q96AY4 2481 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 VWA5AO00534 786 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 SLC25A27O95847 323 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 CLTBP09497 229 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 SH2D4AQ9H788 454 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 A0A1W2PQY0 241 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 STAT3P40763 770 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 KCTD2Q14681 263 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 REPS2Q8NFH8 660 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.16■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 MUC3AQ02505 3323 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 FOSL2P15408 326 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 RNF180Q86T96 592 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 CCDC17Q96LX7 622 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 MYH7P12883 1935 aa20.15■□□□□ 0.82
TDRKH-208ENST00000463553 KIAA0355O15063 1070 aa20.14■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 ADAMTS4O75173 837 aa20.14■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 RAG1P15918 1043 aa20.14■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 CTR9Q6PD62 1173 aa20.14■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 MYADML2A6NDP7 307 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 AKR1A1P14550 325 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 SLC4A3P48751 1232 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 HAUS7Q99871 368 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 RIPK3Q9Y572 518 aa20.13■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 ATP5JP18859 108 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 ACLYP53396 1101 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 FAAP100Q0VG06 881 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 GOPCQ9HD26 462 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 COG6Q9Y2V7 657 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 MCM3APO60318 1980 aa20.12■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.11■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 FPGSQ05932 587 aa20.11■□□□□ 0.81
TDRKH-208ENST00000463553 GRIN2CQ14957 1233 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms