RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 WDR78Q5VTH9 848 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 ZMYM6O95789 1325 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 PRDM1O75626 825 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 FGRP09769 529 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 ERCC3P19447 782 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM32Q13049 653 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 CEP95Q96GE4 821 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 VWA5AO00534 786 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 NDUFB10O96000 172 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 IGHA2P01877 340 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TFAP4Q01664 338 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 CCL14Q16627 93 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 DPP9Q86TI2 863 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FAM227BQ96M60 508 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0D9SFI3 127 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 HIP1O00291 1037 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 ATP2A1O14983 1001 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 ORC4O43929 436 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FDX1P10109 184 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 ADORA2AP29274 412 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 STAT3P40763 770 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NT5C2P49902 561 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 RILPL2Q969X0 211 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 MSCO60682 206 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FGAP02671 866 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FCER1AP12319 257 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 SDSP20132 328 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 PLS1Q14651 629 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 VPS53Q5VIR6 699 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 REPS2Q8NFH8 660 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FEM1BQ9UK73 627 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 RAD21O60216 631 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NOVP48745 357 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 TSPY2A6NKD2 308 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 DPF3Q92784 378 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 GMCL1Q96IK5 515 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NBPF3Q9H094 633 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 PLXNB2O15031 1838 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 PLA2G6O60733 806 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 LHX8Q68G74 356 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 ZBED4O75132 1171 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 BMP3P12645 472 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 OAZ1P54368 228 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 SLFN13Q68D06 897 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 COBLO75128 1261 aa24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 KCTD2Q14681 263 aa24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 FAM160B2Q86V87 743 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 MMP19Q99542 508 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-204ENST00000462123 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms