RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 IL25Q9H293 177 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 TOMM22Q9NS69 142 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 SKAP1Q86WV1 359 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 TICAM2Q86XR7 235 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF3Q9H094 633 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPY2A6NKD2 308 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 USP6NLQ92738 828 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.36■■■□□ 2.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.35■■■□□ 2.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.34■■■□□ 2.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 ERCC3P19447 782 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 RGS2P41220 211 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 MKL1Q969V6 931 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 MTMR7Q9Y216 660 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP5-208ENST00000459627 HIP1O00291 1037 aa28.32■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.32■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 STX8Q9UNK0 236 aa28.32■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 MB21D1Q8N884 522 aa28.31■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.31■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYM6O95789 1325 aa28.31■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 FGRP09769 529 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 GJA8P48165 433 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 APBA2Q99767 749 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC4A3P48751 1232 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 GRB14Q14449 540 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5-208ENST00000459627 REPS2Q8NFH8 660 aa28.29■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.29■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 SGPL1O95470 568 aa28.27■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 ADORA2AP29274 412 aa28.27■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.27■■■□□ 2.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF213O14771 459 aa28.26■■■□□ 2.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC34A2O95436 690 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 BMP3P12645 472 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CHMLP26374 656 aa28.26■■■□□ 2.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH8Q9H579 483 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RIPK3Q9Y572 518 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMA4Q16363 1823 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP2C19P33261 490 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SNAP25P60880 206 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 FEM1BQ9UK73 627 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC1A4P43007 532 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PTH1RQ03431 593 aa28.22■■■□□ 2.11
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