RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440702.5

FAM20B-202, Transcript of FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

TSL 3

Gene FAM20B, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20B-202ENST00000440702 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 MROH8Q9H579 483 aa20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.58■□□□□ 0.89
FAM20B-202ENST00000440702 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.57■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 GPR153Q6NV75 609 aa20.57■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 CTR9Q6PD62 1173 aa20.57■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 SEPT4O43236 478 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 FCER1AP12319 257 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 MAML3Q96JK9 1138 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 MMP19Q99542 508 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.56■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 PGK2P07205 417 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 FERMT2Q96AC1 680 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 GOPCQ9HD26 462 aa20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 DLL1O00548 723 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 TRIM60Q495X7 471 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 MYH4Q9Y623 1939 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 SLC25A27O95847 323 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 LRRC41Q15345 812 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 VWA5AO00534 786 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM20B-202ENST00000440702 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 STAT3P40763 770 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 KCTD2Q14681 263 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 FAM161BQ96MY7 647 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 A0A0C4DFX4 3053 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 RASA1P20936 1047 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SLC4A3P48751 1232 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 PGK1P00558 417 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 RARBP10826 455 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 REPS2Q8NFH8 660 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 OSBP2Q969R2 916 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GPATCH3Q96I76 525 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 BADQ92934 168 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TINF2Q9BSI4 451 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 MCM3APO60318 1980 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 PRDM1O75626 825 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 NDUFB10O96000 172 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TDO2P48775 406 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SNX17Q15036 470 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SHHQ15465 462 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SBK1Q52WX2 424 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 APPBP2Q92624 585 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 M0R2C6 588 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GPAA1O43292 621 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 APPP05067 770 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 COPB2P35606 906 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CPXCR1Q8N123 301 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GUCD1Q96NT3 240 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 NYAP2Q9P242 653 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 PHF24Q9UPV7 400 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 F5H6K3 240 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms