RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSMC4P43686 418 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCGRTP55899 365 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ICA1Q05084 483 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NYAP2Q9P242 653 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PRG0 241 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMIM22K7EJ46 135 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXP2O15409 715 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HERVK_113P62684 666 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COG2Q14746 738 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VPS53Q5VIR6 699 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LBX2Q6XYB7 198 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NBPF11Q86T75 865 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MKL1Q969V6 931 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VCPKMTQ9H867 229 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRRDQ9UH36 339 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYPNQ86TC9 1320 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ORC4O43929 436 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VCAM1P19320 739 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COA7Q96BR5 231 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM47Q96LD4 638 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GOPCQ9HD26 462 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR70Q9NW82 654 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYH8P13535 1937 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD50Q92878 1312 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF213O14771 459 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTLL1O95922 423 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPY3P0CV98 308 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPY8P0CW00 308 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCNA1P78396 465 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAP1Q01518 475 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TFAP4Q01664 338 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MB21D1Q8N884 522 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARMC5Q96C12 935 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPY2A6NKD2 308 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDM1O75626 825 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHMLP26374 656 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CTGFP29279 349 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAPK4P31152 587 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERVK-9P63128 1117 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERVK-24P63145 666 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP2B2Q01814 1243 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAMK2BQ13554 666 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IRF5Q13568 498 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP95Q96GE4 821 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.63□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 F5H6K3 240 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FDX1P10109 184 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAPN2P17655 700 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOVP48745 357 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGS19P49795 217 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLCB2Q00722 1185 aa9.62□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLRC3Q07444 240 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms