RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRKAB2O43741 272 aa22.09■■□□□ 1.13
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC25A27O95847 323 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 PANK1Q8TE04 598 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 MMP19Q99542 508 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.09■■□□□ 1.13
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.08■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC17Q96LX7 622 aa22.08■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.08■■□□□ 1.13
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PGK2P07205 417 aa22.07■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KCTD2Q14681 263 aa22.06■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.05■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYLIPQ8WY64 445 aa22.05■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TINF2Q9BSI4 451 aa22.05■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.05■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.05■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L12C9JPN9 530 aa22.04■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L21D6R901 530 aa22.04■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLTBP09497 229 aa22.04■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.03■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.03■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1W2PQY0 241 aa22.02■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 FOSL2P15408 326 aa22.02■■□□□ 1.12
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAG1P15918 1043 aa22.02■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.02■■□□□ 1.12
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP5JP18859 108 aa22■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 HAUS7Q99871 368 aa22■■□□□ 1.11
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADAMTS4O75173 837 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACLYP53396 1101 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX11Q96FC9 970 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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