RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 PRDM1O75626 825 aa33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM83BQ5T0W9 1011 aa33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPV1Q8NER1 839 aa33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 NBPF3Q9H094 633 aa33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GOPCQ9HD26 462 aa33.36■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 EVI5O60447 810 aa33.35■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP2C19P33261 490 aa33.35■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PLS1Q14651 629 aa33.35■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MFSD14CQ5VZR4 134 aa33.35■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PFASO15067 1338 aa33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 REPS2Q8NFH8 660 aa33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PDE1AP54750 535 aa33.33■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MROH8Q9H579 483 aa33.33■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 C11orf49Q9H6J7 331 aa33.33■■■□□ 2.93
TRIOBP-209ENST00000428075 VWA5AO00534 786 aa33.32■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 COL6A1P12109 1028 aa33.32■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 DPP9Q86TI2 863 aa33.32■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 NCAPG2Q86XI2 1143 aa33.32■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 F5H6K3 240 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 RAD21O60216 631 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 NDUFB10O96000 172 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 KLRC3Q07444 240 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 OLFML2BQ68BL8 750 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 CLIP2Q9UDT6 1046 aa33.31■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 CYBAP13498 195 aa33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ABRAQ8N0Z2 381 aa33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 CEP95Q96GE4 821 aa33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 NACAP1Q9BZK3 213 aa33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 MTMR4Q9NYA4 1195 aa33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 PPARAQ07869 468 aa33.29■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 RIOX2Q8IUF8 465 aa33.29■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 MKL1Q969V6 931 aa33.29■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 FRMPD3Q5JV73 1810 aa33.29■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 EVI5LQ96CN4 794 aa33.28■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 NAPBQ9H115 298 aa33.28■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 TACC3Q9Y6A5 838 aa33.28■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 PLIN4Q96Q06 1357 aa33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC25A27O95847 323 aa33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 VPS53Q5VIR6 699 aa33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 NEDD1Q8NHV4 660 aa33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF287Q9HBT7 754 aa33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
TRIOBP-209ENST00000428075 STAT3P40763 770 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM47AQ5JRC9 791 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SMC5Q8IY18 1101 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 C7orf61Q8IZ16 206 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SLF1Q9BQI6 1058 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 INCENPQ9NQS7 918 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 MYH4Q9Y623 1939 aa33.26■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 FCER1AP12319 257 aa33.25■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 MAML3Q96JK9 1138 aa33.25■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 LNPKQ9C0E8 428 aa33.25■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP33.25■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 IGHDP01880 384 aa33.24■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 CNGA1P29973 690 aa33.24■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 AAMPQ13685 434 aa33.24■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 TFAP4Q01664 338 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 PDE4BQ07343 736 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 EXOC6Q8TAG9 804 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM227BQ96M60 508 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAH12Q6ZR08 3092 aa33.23■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 TTLL1O95922 423 aa33.22■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 PGK2P07205 417 aa33.22■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 CTDSPL2Q05D32 466 aa33.22■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 MMP19Q99542 508 aa33.22■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 RIPK3Q9Y572 518 aa33.22■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 A0A0D9SFI3 127 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPY3P0CV98 308 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPY8P0CW00 308 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC26Q2I0M4 334 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 HELLSQ9NRZ9 838 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDH10Q9P2E7 1040 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa33.21■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SZT2Q5T011 3432 aa33.2■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 MSCO60682 206 aa33.2■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF792Q3KQV3 632 aa33.2■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC5A4Q9NY91 659 aa33.2■■■□□ 2.91
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa33.19■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 GDF15Q99988 308 aa33.19■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 ANAPC4Q9UJX5 808 aa33.19■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 SYN1P17600 705 aa33.18■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 ALX1Q15699 326 aa33.18■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 ANO1Q5XXA6 986 aa33.18■■■□□ 2.9
TRIOBP-209ENST00000428075 TEX13BQ9BXU2 312 aa33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms