RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.05■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.05■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 SMIM22K7EJ46 135 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 PAGE5Q96GU1 130 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 PRDM1O75626 825 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 SPATA1Q5VX52 437 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 USP49Q70CQ1 688 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 CERS3Q8IU89 383 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 TMEM139Q8IV31 216 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 DPYDQ12882 1025 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 NR1I3Q14994 352 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GTH6 734 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ATP2B1P20020 1258 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 GNAQP50148 359 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 TGFB2P61812 414 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 PDILTQ8N807 584 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 FAM205CA6NFA0 338 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 TMEM232C9JQI7 657 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 STYK1Q6J9G0 422 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 DHX58Q96C10 678 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-205ENST00000409985 KLRK1P26718 216 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 GSTO1P78417 241 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 CUL4BQ13620 913 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 REXO1L1PQ8IX06 675 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 IQUBQ8NA54 791 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 EPSTI1Q96J88 318 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 MED15Q96RN5 788 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 A0A087X0B3 334 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PRDX5P30044 214 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PPP4CP60510 307 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 SEMA3FQ13275 785 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 C12orf60Q5U649 245 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 OGFRQ9NZT2 677 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 TSPY2A6NKD2 308 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 NLRP5P59047 1200 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PTGDRQ13258 359 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 GALNT17Q6IS24 598 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 SYT10Q6XYQ8 523 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 E2F4Q16254 413 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 HOMER1Q86YM7 354 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 TC2NQ8N9U0 490 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PANX2Q96RD6 677 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 ZNF174Q15697 407 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 KAT14Q9H8E8 782 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 ALDH1B1P30837 517 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 SYT17Q9BSW7 474 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 BBOX1O75936 387 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 LDHCP07864 332 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 BAG3O95817 575 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 GRM4Q14833 912 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-205ENST00000409985 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 BLIDQ8IZY5 108 aa26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 RMND1Q9NWS8 449 aa26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.95■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms