RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NBPF3Q9H094 633 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 GOPCQ9HD26 462 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 COBLO75128 1261 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 CYP2C19P33261 490 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NCAPG2Q86XI2 1143 aa26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 FOXP2O15409 715 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 STRNO43815 780 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 DPP9Q86TI2 863 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 TRPV1Q8NER1 839 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NYAP2Q9P242 653 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 STAP2Q9UGK3 403 aa26.86■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 PDE1AP54750 535 aa26.85■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 MROH8Q9H579 483 aa26.85■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.85■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 PFASO15067 1338 aa26.85■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 REPS2Q8NFH8 660 aa26.84■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 PRO3102Q9H379 93 aa26.84■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 F5H6K3 240 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 VWA5AO00534 786 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NDUFB10O96000 172 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 KLRC3Q07444 240 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 CEP95Q96GE4 821 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 NAPBQ9H115 298 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.83■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 COL6A1P12109 1028 aa26.82■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PPARAQ07869 468 aa26.82■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.82■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 CYBAP13498 195 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 CNGA1P29973 690 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 VPS53Q5VIR6 699 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 EVI5LQ96CN4 794 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 LNPKQ9C0E8 428 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 INCENPQ9NQS7 918 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.8■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 MKL1Q969V6 931 aa26.8■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.8■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 SLC25A27O95847 323 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 FCER1AP12319 257 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 STAT3P40763 770 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.79■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PGK2P07205 417 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 TFAP4Q01664 338 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 PDE4BQ07343 736 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 MAML3Q96JK9 1138 aa26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 TTLL1O95922 423 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 IGHDP01880 384 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 TSPY3P0CV98 308 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 TSPY8P0CW00 308 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 ANO1Q5XXA6 986 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 SMC5Q8IY18 1101 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 FAM227BQ96M60 508 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 MMP19Q99542 508 aa26.77■■□□□ 1.88
KDELR3-202ENST00000409006 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 RIPK3Q9Y572 518 aa26.76■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 A0A0D9SFI3 127 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 SYN1P17600 705 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 AAMPQ13685 434 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.75■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 MSCO60682 206 aa26.74■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.74■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 MCM3APO60318 1980 aa26.73■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.73■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 SLFN13Q68D06 897 aa26.73■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
KDELR3-202ENST00000409006 KIFC2Q96AC6 838 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms