RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 BLIDQ8IZY5 108 aa20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 STX8Q9UNK0 236 aa20.52■□□□□ 0.88
UBQLN4-201ENST00000368309 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CARD6Q9BX69 1037 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 SCN7AQ01118 1682 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CPVLQ9H3G5 476 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.51■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TSPY3P0CV98 308 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TSPY8P0CW00 308 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TRAPPC10P48553 1259 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 DGKHQ86XP1 1220 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 MNS1Q8NEH6 495 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PLIN2Q99541 437 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RFC4P35249 363 aa20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 A0A1B0GUL6 1792 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PP2D1A8MPX8 630 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CALML3P27482 149 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CASQ1P31415 396 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 UBXN4Q92575 508 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 A0A0U1RQJ8 604 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CYTH3O43739 400 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 VPS16Q9H269 839 aa20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CASP14P31944 242 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GDAQ9Y2T3 454 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 INF2Q27J81 1249 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 EPC1Q9H2F5 836 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.48■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 VPS72Q15906 364 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 N4BP3O15049 544 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 BAG3O95817 575 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 STAT6P42226 847 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT31Q15323 416 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.47■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RGL2O15211 777 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PBX1P40424 430 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GRAPQ13588 217 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 DMTNQ08495 405 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 GRM4Q14833 912 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 NELFBQ8WX92 580 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 PANX2Q96RD6 677 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.46■□□□□ 0.87
UBQLN4-201ENST00000368309 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 CLCN6P51797 869 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 TXLNAP40222 546 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 PAK1Q13153 545 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 GYPCP04921 128 aa20.45■□□□□ 0.86
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC175P0C221 793 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms