RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368063.5

NCSTN-202, Transcript of nicastrin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCSTN, Length 3,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTN-202ENST00000368063 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CHP1Q99653 195 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 MRC1P22897 1456 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 ANO9A1A5B4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 C5orf60A6NFR6 353 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 A6NHS1 94 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CLSTN1O94985 981 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 GHRP10912 638 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 ITIH3Q06033 890 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 P3H4Q92791 437 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 TFR2Q9UP52 801 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 RIPK1Q13546 671 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 BLMHQ13867 455 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CCT6BQ92526 530 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SENP2Q9HC62 589 aa14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SEMA3EO15041 775 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 MSL1Q68DK7 614 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CHST3Q7LGC8 479 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 HVCN1Q96D96 273 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 A0A0G2JLW4 131 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 E7EWF7 191 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 NEFHP12036 1026 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CREG2Q8IUH2 290 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 FBXL16Q8N461 479 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SPATA20Q8TB22 786 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
NCSTN-202ENST00000368063 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 GMNCA6NCL1 334 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 PPIP5K2O43314 1243 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 FAM163BP0C2L3 166 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 SLC7A5Q01650 507 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CUL4BQ13620 913 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 STIM2Q9P246 746 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 TRAPPC3O43617 180 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 PDIA5Q14554 519 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CFAP58Q5T655 872 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CNKSR1Q969H4 720 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 EID1Q9Y6B2 187 aa14.64□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 TEFQ10587 303 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 C4AP0C0L4 1744 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 C4BP0C0L5 1744 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 FERP16591 822 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 KRT9P35527 623 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 LAMB3Q13751 1172 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 TRIM14Q14142 442 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 VPS37DQ86XT2 251 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 PPARAQ07869 468 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 MREGQ8N565 214 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 NDST4Q9H3R1 872 aa14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NCSTN-202ENST00000368063 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms