RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 DOCK1Q14185 1865 aa20.61■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 F5H6K3 240 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 KLRC3Q07444 240 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 FEZ1Q99689 392 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 CYTH3O43739 400 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 PKN1Q16512 942 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 MCTP1Q6DN14 999 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 KLRG1Q96E93 195 aa20.6■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 SLC16A2P36021 539 aa20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 SLC1A4P43007 532 aa20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 WASF1Q92558 559 aa20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 TMX2Q9Y320 296 aa20.59■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 KRT40Q6A162 431 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 HOMER1Q86YM7 354 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 DCAF4Q8WV16 495 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 PICK1Q9NRD5 415 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.58■□□□□ 0.89
LTV1-201ENST00000367576 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 TRIM29Q14134 588 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 MOB2Q70IA6 237 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 TRAF5O00463 557 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 DGKZQ13574 1117 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 21.7
LTV1-201ENST00000367576 SHISA4Q96DD7 197 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GOPCQ9HD26 462 aa20.57■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 MYH6P13533 1939 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SCG2P13521 617 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 NF2P35240 595 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 RESTQ13127 1097 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PIGSQ96S52 555 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SH2D4AQ9H788 454 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.56■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 NFKBIBQ15653 356 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GMCL1Q96IK5 515 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 VCPKMTQ9H867 229 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GINM1Q9NU53 330 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 OTOFQ9HC10 1997 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 BMP3P12645 472 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PTPRAP18433 802 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 VGLL4Q14135 290 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GBP4Q96PP9 640 aa20.55■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 KIF28PB7ZC32 967 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 USP17L10C9JJH3 530 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 TMEM232C9JQI7 657 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 MTMR2Q13614 643 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 TRIM75PA6NK02 468 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 MAP3K9P80192 1104 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SPP2Q13103 211 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 SNAP25P60880 206 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 NBR1Q14596 966 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 MMP1P03956 469 aa20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 LDHDQ86WU2 507 aa20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.6 ms