RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361496.3

RCSD1-201, Transcript of RCSD domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RCSD1, Length 822 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1-201ENST00000361496 PTPREP23469 700 aa23.57■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TRIB2Q92519 343 aa23.57■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TSPY2A6NKD2 308 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SGPL1O95470 568 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 NDUFB10O96000 172 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TRIM32Q13049 653 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 MAP2K5Q13163 448 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.56■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 MYH4Q9Y623 1939 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 ERCC3P19447 782 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SHISA4Q96DD7 197 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 DEFB118Q96PH6 123 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TOMM22Q9NS69 142 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.55■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 STRNO43815 780 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TTC22Q5TAA0 569 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 APBA2Q99767 749 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 RPTORQ8N122 1335 aa23.54■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 VWA5AO00534 786 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 ORC4O43929 436 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 FGRP09769 529 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 HAND2P61296 217 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 CCL14Q16627 93 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 MROH8Q9H579 483 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 ZMYM6O95789 1325 aa23.53■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 GRB14Q14449 540 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SLFN13Q68D06 897 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 DPP9Q86TI2 863 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 STX8Q9UNK0 236 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 PARP14Q460N5 1801 aa23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RCSD1-201ENST00000361496 NMT2O60551 498 aa23.51■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 SLC25A27O95847 323 aa23.51■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 HOXC6P09630 235 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CAPN2P17655 700 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 STAT3P40763 770 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.5■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF213O14771 459 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 BMP3P12645 472 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ADORA2AP29274 412 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 FEM1BQ9UK73 627 aa23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ZBED4O75132 1171 aa23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 REPS2Q8NFH8 660 aa23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 KIFC2Q96AC6 838 aa23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 NEFLP07196 543 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 FCER1AP12319 257 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 MCCP23508 829 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 SLC1A4P43007 532 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 NBPF3Q9H094 633 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.47■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 TMEM232C9JQI7 657 aa23.46■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 COBLO75128 1261 aa23.46■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 COPB2P35606 906 aa23.46■■□□□ 1.35
RCSD1-201ENST00000361496 SLC4A3P48751 1232 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms