RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ADCY3O60266 1144 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ELNP15502 786 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MAPK4P31152 587 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NOVP48745 357 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IRF5Q13568 498 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 BMP2KLQ5H9B9 411 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SLFN13Q68D06 897 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 POTEFA5A3E0 1075 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CCNA1P78396 465 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MTFR1Q15390 333 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF11Q86T75 865 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 REPS2Q8NFH8 660 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PLS1Q14651 629 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MORN1Q5T089 497 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 WDR78Q5VTH9 848 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MB21D1Q8N884 522 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ESR2Q92731 530 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 USP6NLQ92738 828 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TAF6LQ9Y6J9 622 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 BRCA2P51587 3418 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 B4E1Z4 1266 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 VWA5AO00534 786 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KDM4AO75164 1064 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 BMP3P12645 472 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2B6P20813 491 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MCCP23508 829 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RGS19P49795 217 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR7Q9Y216 660 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 INHAP05111 366 aa17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CYP21A2P08686 494 aa17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC3P19447 782 aa17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM32Q13049 653 aa17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 GMCL1Q96IK5 515 aa17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM232C9JQI7 657 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PTPREP23469 700 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SLC1A4P43007 532 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 GRB14Q14449 540 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD1Q719H9 257 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TRIB2Q92519 343 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MAP4K1Q92918 833 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KIFC2Q96AC6 838 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 FEM1BQ9UK73 627 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CCL5P13501 91 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 UBXN2AP68543 259 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MAP2K5Q13163 448 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CCL14Q16627 93 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HMGCRP04035 888 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 EN2P19622 333 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 STAT3P40763 770 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 RGS2P41220 211 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 STAT2P52630 851 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC96Q2M329 555 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 APBA2Q99767 749 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms