RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 USP17L5A8MUK1 530 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.51□□□□□ -0.09
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GGPS1-202ENST00000358966 SCG2P13521 617 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-202ENST00000358966 SLC39A14Q15043 492 aa14.51□□□□□ -0.09
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GGPS1-202ENST00000358966 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
GGPS1-202ENST00000358966 POLD1P28340 1107 aa14.45□□□□□ -0.1
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