RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 LAMB1P07942 1786 aa22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 CD209Q9NNX6 404 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 F8W031 263 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 INF2Q27J81 1249 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-201ENST00000343028 DESI2Q9BSY9 194 aa22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RASA1P20936 1047 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 ELF2Q15723 593 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 MFSD14BQ5SR56 506 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 USP17L2Q6R6M4 530 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 DGKHQ86XP1 1220 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIML1Q8N9V2 468 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SBF2Q86WG5 1849 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 C6orf229H3BNL8 230 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RIMBP2O15034 1052 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SERPINB2P05120 415 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM139Q8IV31 216 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TEX11Q8IYF3 940 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TC2NQ8N9U0 490 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM60Q9H2L4 133 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 FANCGO15287 622 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 MTF1Q14872 753 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GYS1P13807 737 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 IQUBQ8NA54 791 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 POLLQ9UGP5 575 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 BMP15O95972 392 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PICALMQ13492 652 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 E2F4Q16254 413 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 EYA3Q99504 573 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GGA1Q9UJY5 639 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GDAQ9Y2T3 454 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 KLRF2D3W0D1 207 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 RGL2O15211 777 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CDK8P49336 464 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GSTO1P78417 241 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GRM4Q14833 912 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 KCND1Q9NSA2 647 aa21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 NR1I3Q14994 352 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA1Q5VX52 437 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 GSDMAQ96QA5 445 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 CALML3P27482 149 aa21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 MXD3Q9BW11 206 aa21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-201ENST00000343028 LDHCP07864 332 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 SLURP2P0DP57 97 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 FLT1P17948 1338 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 STAT6P42226 847 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 GTF2IP78347 998 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A0U1RQJ8 604 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 ST5P78524 1137 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP95Q96GE4 821 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 NHSQ6T4R5 1651 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A1B0GTH6 734 aa21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 STXBP3O00186 592 aa21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP4CP60510 307 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms