RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336283.7

SRA1-201, Transcript of steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRA1, Length 2,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1-201ENST00000336283 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TMX1Q9H3N1 280 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TMEM232C9JQI7 657 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TUBB4AP04350 444 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 RASA1P20936 1047 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 IQUBQ8NA54 791 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF592Q92610 1267 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 MED15Q96RN5 788 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 INTS13Q9NVM9 706 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CCP110O43303 1012 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 MCM7P33993 719 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TEX11Q8IYF3 940 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 KIF18AQ8NI77 898 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 M0R2N6 131 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ADAMTS3O15072 1205 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 E2F4Q16254 413 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ANKRD7Q92527 254 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CDK8P49336 464 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 IL17AQ16552 155 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SPATA1Q5VX52 437 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CUL4BQ13620 913 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TMC4Q7Z404 712 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 BARHL2Q9NY43 387 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 POLLQ9UGP5 575 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 STX8Q9UNK0 236 aa16.02■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GAKO14976 1311 aa16.02■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.02■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CYTH3O43739 400 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 RHBDL3P58872 404 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 NR1I3Q14994 352 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 EYA3Q99504 573 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 FLT1P17948 1338 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 STXBP3O00186 592 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.01■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 A0A1B0GTH6 734 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CD44P16070 742 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CASP1P29466 404 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 TXLNAP40222 546 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 DDR1Q08345 913 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SNED1Q8TER0 1413 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SMARCA1P28370 1054 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 KLRF2D3W0D1 207 aa15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 ARHGAP6O43182 974 aa15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SP8Q8IXZ3 490 aa15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.99■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 C6orf229H3BNL8 230 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 LAD1O00515 517 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 NOVP48745 357 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 TMEM139Q8IV31 216 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 MYH1P12882 1939 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.98■□□□□ 0.15
SRA1-201ENST00000336283 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms