RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 GNPTABQ3T906 1256 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC24Q50LG9 513 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 BLIDQ8IZY5 108 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KRT15P19012 456 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 MGARPQ8TDB4 240 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 POLR2MP0CAP2 368 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 IGBP1P78318 339 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KRT81Q14533 505 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 NAA25Q14CX7 972 aa24.7■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PANK4Q9NVE7 773 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 HACE1Q8IYU2 909 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFAB1O14561 156 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PHKG2P15735 406 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PFKFB1P16118 471 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CUL4BQ13620 913 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 KDRP35968 1356 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ18B7U540 433 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNDQ07001 517 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ12Q14500 433 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SPC25Q9HBM1 224 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TNFAIP1Q13829 316 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 MORC3Q14149 939 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 POLA2Q14181 598 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 I3L4J1 428 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB2AQ13885 445 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA1Q8ND90 353 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2B4P23634 1241 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ITKQ08881 620 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO11Q86XK2 927 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TNKSO95271 1327 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 BUB1O43683 1085 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 GNA14O95837 355 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PDE6AP16499 860 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A2P55011 1212 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 STAM2O75886 525 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 KLRF2D3W0D1 207 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP6O43182 974 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ICA1Q05084 483 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 AMFRQ9UKV5 643 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 WDR62O43379 1518 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 MCUR1Q96AQ8 359 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYM6O95789 1325 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN9O14815 690 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY2FP51841 1108 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TNNC2P02585 160 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PAK2Q13177 524 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 RAB20Q9NX57 234 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM232C9JQI7 657 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 LGSNQ5TDP6 509 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 COX16Q9P0S2 106 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 FANCBQ8NB91 859 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM50Q86XT4 487 aa24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms