RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS3O15072 1205 aa24.49■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SLC20A2Q08357 652 aa24.49■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 FOXN1O15353 648 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ZNF174Q15697 407 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 FOCADQ5VW36 1801 aa24.48■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 USP49Q70CQ1 688 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 PDILTQ8N807 584 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 GNAQP50148 359 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 TTC38Q5R3I4 469 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.46■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CEP95Q96GE4 821 aa24.45■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CYTH3O43739 400 aa24.45■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CPVLQ9H3G5 476 aa24.45■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.45■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 USP40Q9NVE5 1235 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CALML3P27482 149 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CDC25BP30305 580 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.44■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 H0YIN7 160 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 BLIDQ8IZY5 108 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 EPSTI1Q96J88 318 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 KLRF2D3W0D1 207 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 BMP15O95972 392 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PTGDRQ13258 359 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 POSTNQ15063 836 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.43■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PRR29P0C7W0 189 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CHRNA5P30532 468 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 MCM7P33993 719 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 LRMPQ12912 555 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TEKT1Q969V4 418 aa24.42■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 VGLL3A8MV65 326 aa24.41■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CEP135Q66GS9 1140 aa24.41■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 FERMT2Q96AC1 680 aa24.41■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 DHX58Q96C10 678 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TPM4P67936 248 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 NCAPHQ15003 741 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.4■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 A0A087X0B3 334 aa24.39■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 TRAPPC10P48553 1259 aa24.39■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 HOMER1Q86YM7 354 aa24.39■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 SLX4Q8IY92 1834 aa24.39■■□□□ 1.5
MESP1-201ENST00000300057 STXBP3O00186 592 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 AKR1B1P15121 316 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 GABPAQ06546 454 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 STYK1Q6J9G0 422 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 PODNQ7Z5L7 613 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.39■■□□□ 1.49
MESP1-201ENST00000300057 BARHL2Q9NY43 387 aa24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms