RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CYTH3O43739 400 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFB10O96000 172 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PKN1Q16512 942 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 DLK2Q6UY11 383 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FERMT3Q86UX7 667 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA5Q96FF9 252 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PICK1Q9NRD5 415 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FZD1Q9UP38 647 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 XBP1P17861 261 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD1Q719H9 257 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RRAGCQ9HB90 399 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FEZ1Q99689 392 aa23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SCG2P13521 617 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKG1Q13976 671 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT40Q6A162 431 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 MCTP1Q6DN14 999 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.436e-7■■□□□ 13.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CPVLQ9H3G5 476 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 VCPKMTQ9H867 229 aa23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3-201ENST00000298838 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 OTOFQ9HC10 1997 aa23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEIP0CG38 1075 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEJP0CG39 1038 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP3P12645 472 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 RESTQ13127 1097 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 NFKBIBQ15653 356 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRAP18433 802 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP1P03956 469 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K9P80192 1104 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 HOMER1Q86YM7 354 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 LDHDQ86WU2 507 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR18Q9BV38 432 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 CSADQ9Y600 493 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A2P36021 539 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 LPAR1Q92633 364 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGSQ96S52 555 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L10C9JJH3 530 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 VGLL4Q14135 290 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM232C9JQI7 657 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MCM4P33991 863 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 USP14P54578 494 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TCHHQ07283 1943 aa23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 STAT2P52630 851 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SPP2Q13103 211 aa23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR2Q13614 643 aa23.89■■□□□ 1.42
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