RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 FAM13AO94988 1023 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CASP1P29466 404 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CDC25AP30304 524 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 GUCY2FP51841 1108 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 GNGT1P63211 74 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TUBB4BP68371 445 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 RBL2Q08999 1139 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 NR5A1Q13285 461 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ANKRD7Q92527 254 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MYO1CO00159 1063 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KRT13P13646 458 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KIF22Q14807 665 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 USP37Q86T82 979 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TTLL6Q8N841 843 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 OSBP2Q969R2 916 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MAGEA1P43355 309 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ABCB6Q9NP58 842 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PALLDQ8WX93 1383 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 SARM1Q6SZW1 724 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 COPRSQ9NQ92 184 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KDRP35968 1356 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KCNQ2O43526 872 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 BBOX1O75936 387 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 VSTM4Q8IW00 320 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 DPF2Q92785 391 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 M0R2C6 588 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 NAA25Q14CX7 972 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 IQCB1Q15051 598 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 DYMQ7RTS9 669 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCDC25Q86WR0 208 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCDC93Q567U6 631 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 SPC25Q9HBM1 224 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PREX2Q70Z35 1606 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCDC151A5D8V7 595 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TRAF5O00463 557 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ALAS1P13196 640 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CSRNP2Q9H175 543 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TRIM66O15016 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 RNF40O75150 1001 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 WDR24Q96S15 920 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 XDHP47989 1333 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KCNJ18B7U540 433 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 IKBKBO14920 756 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 BTDP43251 543 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCZ1BP86790 482 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 KCNJ12Q14500 433 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 APOA5Q6Q788 366 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PSMD1Q99460 953 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PIM2Q9P1W9 311 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CYP27B1O15528 508 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 CXCR5P32302 372 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 PHKA1P46020 1223 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS3-201ENST00000296051 MTF1Q14872 753 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms