RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 FCER1AP12319 257 aa23.5■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.5■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.5■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.49■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 DNM1LO00429 736 aa23.49■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A27O95847 323 aa23.49■■□□□ 1.35
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CXCL3-201ENST00000296026 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.49■■□□□ 1.35
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CXCL3-201ENST00000296026 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.48■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 ANO1Q5XXA6 986 aa23.48■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 TDHQ8IZJ6 230 aa23.48■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 MAML3Q96JK9 1138 aa23.48■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.48■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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CXCL3-201ENST00000296026 SEPT4O43236 478 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 GPAA1O43292 621 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.47■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 SZT2Q5T011 3432 aa23.47■■□□□ 1.35
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CXCL3-201ENST00000296026 MMP19Q99542 508 aa23.46■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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CXCL3-201ENST00000296026 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 M0R2C6 588 aa23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 APPP05067 770 aa23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 GNAT2P19087 354 aa23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 TDO2P48775 406 aa23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.44■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PGK2P07205 417 aa23.44■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD2Q14681 263 aa23.44■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 REPS2Q8NFH8 660 aa23.44■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.44■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 KBTBD13C9JR72 458 aa23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 F5H6K3 240 aa23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 RTP1P59025 263 aa23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 KLRC3Q07444 240 aa23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.43■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ERC2O15083 957 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM1O75626 825 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 COPB2P35606 906 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 GPR153Q6NV75 609 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.42■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFB10O96000 172 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 TINF2Q9BSI4 451 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.41■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC41Q15345 812 aa23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 FSD1Q9BTV5 496 aa23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.4■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 MYH4Q9Y623 1939 aa23.39■■□□□ 1.34
CXCL3-201ENST00000296026 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.39■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 CEP95Q96GE4 821 aa23.39■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.39■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB123Q8N688 67 aa23.38■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 MKL1Q969V6 931 aa23.38■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 FERMT2Q96AC1 680 aa23.38■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.38■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 RIPK3Q9Y572 518 aa23.38■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 RARBP10826 455 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A3P48751 1232 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 Q7L0L9 218 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 CPXCR1Q8N123 301 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.37■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 ZBED4O75132 1171 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL1O95922 423 aa23.36■■□□□ 1.33
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