RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 FAM122AQ96E09 287 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 THEGQ9P2T0 379 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PRG0 241 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 FLOT1O75955 427 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PGK1P00558 417 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TIMP1P01033 207 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PLA2G5P39877 138 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PLCD1P51178 756 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MAP3K12Q12852 859 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.56□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MUC3AQ02505 3323 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 AKR1A1P14550 325 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 FAAP100Q0VG06 881 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 KCTD2Q14681 263 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MMP19Q99542 508 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TINF2Q9BSI4 451 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ACLYP53396 1101 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MFSD5Q6N075 450 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ATG4CQ96DT6 458 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SH2D4AQ9H788 454 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.54□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 GABPAQ06546 454 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TMEM199Q8N511 208 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PBX4Q9BYU1 374 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MSRAQ9UJ68 235 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.53□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PGK2P07205 417 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 COPB2P35606 906 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TMEM240Q5SV17 173 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TMX2Q9Y320 296 aa14.52□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS4O75173 837 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 IGFBP4P22692 258 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 RAB30Q15771 203 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 KCNA10Q16322 511 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 VCPKMTQ9H867 229 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 SWAP70Q9UH65 585 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 TBX21Q9UL17 535 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ELP1O95163 1332 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 PBX2P40425 430 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 STAT3P40763 770 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ATP8B2P98198 1209 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 RASIP1Q5U651 963 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 SSH3Q8TE77 659 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 SPC25Q9HBM1 224 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.49□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 TRIM27P14373 513 aa14.49□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 CSF2RAP15509 400 aa14.49□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ICA1Q05084 483 aa14.49□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPC25-201ENST00000282074 ZNF365Q70YC5 407 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms