RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1328Q86T90 577 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SDF4Q9BRK5 362 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 BATF3Q9NR55 127 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 LAMA4Q16363 1823 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SCN7AQ01118 1682 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 AP1G2O75843 785 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SNCBQ16143 134 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 COQ9O75208 318 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GNGT1P63211 74 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 NAA25Q14CX7 972 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ATL3Q6DD88 541 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 COG1Q8WTW3 980 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 DPF2Q92785 391 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SAMM50Q9Y512 469 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MYH7P12883 1935 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 LPIN2Q92539 896 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MYO1BO43795 1136 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PFKFB2O60825 505 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ZNF202O95125 648 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ATP1A3P13637 1013 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GYS1P13807 737 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PRPHP41219 470 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CDR1P51861 262 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 STK3Q13188 491 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ERFEQ4G0M1 354 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZUG5 572 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SH3GL2Q99962 352 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 EHD4Q9H223 541 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 LAMB2P55268 1798 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 NEFHP12036 1026 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GGCXP38435 758 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CFAP100Q494V2 611 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 BRF1Q92994 677 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SETDB2Q96T68 719 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SERPINC1P01008 464 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 APPBP2Q92624 585 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SLC15A2Q16348 729 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CEP57Q86XR8 500 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SAAL1Q96ER3 474 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 H3BQV1 296 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 KIF5CO60282 957 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 IFFO2Q5TF58 517 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.58■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 E7EWF7 191 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CCDC175P0C221 793 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 RTL9Q8NET4 1388 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 NDUFAB1O14561 156 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 DRP2Q13474 957 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 NFIXQ14938 502 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 STK32BQ9NY57 414 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TAF1P21675 1872 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 AGPSO00116 658 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC8A1P32418 973 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 ADD2P35612 726 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 TCP11Q8WWU5 503 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 MYO6Q9UM54 1294 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE9A4FU28 777 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 GPAA1O43292 621 aa24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PITX1-201ENST00000265340 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms