RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.64■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 RTN2O75298 545 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM107AO95990 144 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SNCBQ16143 134 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR59Q6PJI9 974 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 EGFL6Q8IUX8 553 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 AIDAQ96BJ3 306 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SNX12Q9UMY4 172 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IFNAR1P17181 557 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 USP49Q70CQ1 688 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 COPS6Q7L5N1 327 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IQCKQ8N0W5 287 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MREGQ8N565 214 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.63■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A087X0B3 334 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC26A0AVF1 554 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNJ18B7U540 433 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF185O15231 689 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CDR1P51861 262 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TIMM10P62072 90 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNJ12Q14500 433 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP2R5AQ15172 486 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 NLRP14Q86W24 1093 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ZIM3Q96PE6 472 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 VPS16Q9H269 839 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LRP6O75581 1613 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA1328Q86T90 577 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 STIM2Q9P246 746 aa20.62■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1B0GUA9 196 aa20.61■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IDEP14735 1019 aa20.61■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXO4P98177 505 aa20.61■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.61■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CIAO1O76071 339 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LIFRP42702 1097 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SGSM3Q96HU1 749 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC8A1P32418 973 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC8A3P57103 927 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 PAK1Q13153 545 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MICU3Q86XE3 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 MB21D1Q8N884 522 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LY9Q9HBG7 655 aa20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 DISP2A7MBM2 1401 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ATRNO75882 1429 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LGALS16A8MUM7 142 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 NR1D1P20393 614 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 AFMP43652 599 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CDK17Q00537 523 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 UBXN1Q04323 297 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM228AQ86W67 206 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 FUKQ8N0W3 1084 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ABTB2Q8N961 1025 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM58Q8NG06 486 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.59■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A087WZG4 1122 aa20.58■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 RCCD1A6NED2 376 aa20.58■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 RXRAP19793 462 aa20.58■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 264.5 ms