RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adcy8P97490 1249 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Myo1gQ5SUA5 1024 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Frmd4bQ920B0 1035 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CopeO89079 308 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp8a2P98200 1148 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Daam2Q80U19 1115 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cep104Q80V31 926 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nlgn1Q99K10 843 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LpxnQ99N69 386 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pdzd9Q9D9M4 266 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pdzd4Q9QY39 772 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dach1Q9QYB2 751 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gna15P30678 374 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 InsrrQ9WTL4 1300 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adcy10Q8C0T9 1614 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Psmc2P46471 433 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Apol7eQ3UZ24 369 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa15.88■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 1700029H14RikE9PY36 240 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Samsn1P57725 372 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl14Q69ZK5 630 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp174B9EJW5 407 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Xrcc6P23475 608 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cage1Q5IR70 849 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rps6ka5Q8C050 863 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Card6E9PWH2 1175 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stx2Q00262 289 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ppp2r5eQ61151 467 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ifit1Q64282 463 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LrgukQ9D5S7 820 aa15.87■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5936A2BG95 728 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5640A3KG49 728 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl40Q9D783 621 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Camsap3Q80VC9 1252 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Armc2Q3URY6 854 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fbxo41Q6NS60 873 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cnot10Q8BH15 744 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lzts2Q91YU6 671 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ttc1Q91Z38 292 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MesdQ9ERE7 224 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 1700006A11RikB9EHI3 544 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Xbp1O35426 267 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cfap36Q8C6E0 343 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Apol10aQ8CCA5 318 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ttc4Q8R3H9 386 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atg3Q9CPX6 314 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prl3d1P18121 224 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Micall2Q3TN34 1009 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc68Q8BVC4 333 aa15.86■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PsdQ5DTT2 1024 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 D130040H23RikQ8BII3 405 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abcc2Q8VI47 1543 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnk16G5E845 292 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stox1B2RQL2 990 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pfkfb1P70266 471 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gli2Q0VGT2 1544 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Krt18P05784 423 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Csrnp1P59054 583 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tshz1Q5DTH5 1084 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf219Q6IQX8 726 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kif11Q6P9P6 1052 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PaoxQ8C0L6 504 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trim60Q8VI40 466 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Serpinb12Q9D7P9 423 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NppbP40753 121 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pik3caP42337 1068 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pnma5Q5DTT8 618 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dzip3Q7TPV2 1204 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gdap1l1Q8VE33 370 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc97Q9DBT3 340 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa15.85■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pagr1bF6V0H0 108 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scyl2Q8CFE4 930 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pagr1aQ99L02 253 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Peg3Q3URU2 1571 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mylk2Q8VCR8 613 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sytl1Q99N80 567 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc13a1Q9JHI4 594 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MefvQ9JJ26 767 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PtprgQ05909 1442 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TnnQ80Z71 1560 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm4297D3YWB7 211 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc153P0C7Q1 202 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tubgcp2Q921G8 905 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abcc1O35379 1528 aa15.84■□□□□ 0.13
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tnnc2P20801 160 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms